Γεννημένη στην Αττική, η Δρ. Ελένη Πιλιλή μεγάλωσε σε ένα οικογενειακό περιβάλλον με μακρά παράδοση στην Οδοντιατρική επιστήμη από την πλευρά της μητέρας της, γεγονός που καθόρισε την επαγγελματική της πορεία.

Το 2009 εισήχθη στην Οδοντιατρική Σχολή του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (ΕΚΠΑ). Μετά τη λήψη του πτυχίου της, εμβάθυνε την επιστημονική και κλινική της κατάρτιση παρακολουθώντας στενά την κλινική πράξη καταξιωμένου Οδοντιάτρου-Προσθετολόγου. Κατά τη διάρκεια της θητείας της αυτής, απέκτησε πολύτιμη κλινική εμπειρία και εξειδικευμένες γνώσεις στην εφαρμογή προηγμένων τεχνικών γύρω από τα οδοντικά εμφυτεύματα και την προσθετική αποκατάσταση ολικού τόξου.